脑膜炎球菌侵入人体后，引起患者发病要经过感染和致病两个阶段。

　　人类上呼吸道是脑膜炎双球菌惟一的自然生存环境，其中主要是鼻咽部粘膜表面环境。当机体免疫力下降，细菌侵入粘膜下层，进入毛细血管和小动脉，侵入血液循环，形成短暂血症。病原菌还可通过血脑屏障进入脑脊髓膜引起化脓性炎症。

　　败血症期主要病变使血管内皮损害，血管壁炎症、坏死、血栓形成、血管周围出血；皮肤粘膜及心、肺、胃肠道等组织器官均可广泛性出血。

　　脑膜炎期间，脑脊髓膜化脓性炎症及脑实质受累，出现炎症、水肿及出血，临床上出现惊厥、昏迷等症状，严重者可出现脑疝，导致呼吸衰竭而死亡。