从公元前221年，秦始皇统一中国，实行郡县制苏州吴中区地图，建立吴县算起，则有二千多年历史。秦初苏州吴中区地图，吴县地域广大，包括现在的常熟、吴江、嘉兴等地在内。秦之后，吴县的地域、辖属屡有变化。至东汉末年，吴地属孙权割据地。晋武帝灭孙皓，分天下为十九州，吴属扬州。晋太康四年（283）县境北部析置海虞县（今常熟市）。宋、齐、梁、陈四代吴县均为吴郡。梁代侯景之乱时，吴郡一度还曾被称为吴州，后吴州、吴郡、吴县治所同驻一城。

隋开皇九年（589）改吴州为苏州。十一年（591）吴县县治迁徙至横山（今新郭镇）。唐武周万岁通天元年（696）析吴县东部地置长洲县，两县分境合城而治。北宋太平兴国三年（978），吴、长洲两县均属浙江西路。清雍正二年（1724），划长洲县东南部建立元和县，与吴县、长洲县合城而治。后又划吴县东山、西山建太湖、靖湖两厅。至1912年，复并三县两厅为吴县。1928年，划吴县城区设苏州市，1930年撤销市建置，辖区复归吴县。

1949年4月27日，吴县解放，市、县分设，析城区和郊区置苏州市，周围乡村为吴县，东山、西山及太湖湖区划建太湖行政办事处。1953年5月，苏南人民行政公署太湖办事处改建震泽县。1959年撤销震泽县，复并入吴县，隶属苏州专员公署（1960年1月7日，国务院批准撤销震泽县，并入吴县）。

解放后的吴县，没有另建县城，全县的党政机关驻于苏州市区。为了适应改革开放的需要，1984年开始，吴县在离苏州市中心约3千米的城南开辟总面积为20平方千米的新城区。1989年8月，吴县机关迁入新城区。

1995年6月8日，国务院批准，撤销吴县，设立吴县市，以原吴县行政区域为吴县市区域，市人民政府驻长桥镇。

2004年底行政区划一览：

甪直镇 面积 63.99平方千米，人口 78985人。

光福镇 面积 69.12平方千米，人口 56658人。

藏书镇 面积 43.97平方千米，人口 31172人。

木渎镇 面积 38.23平方千米，人口人。

胥口镇 面积100.00平方千米，人口 20423人。

浦庄镇 面积 28.75平方千米，人口 29580人。

渡村镇 面积 29.79平方千米，人口 32851人。

东山镇 面积 63.00平方千米，人口 56044人。

西山镇 面积 83.42平方千米，人口 42668人。