(一)销售点实时管理系统(POS)
　　POS，Point of Sales，POS系统即销售时点信息系统，是结合销售终端POS机或收款机进行管理的子系统，需要将各种销售柜台的收款机与计算机用网络通信技术进行连接。
　　该子系统负责对以销售环节为中心的商品流通过程进行实时监控将每一笔业务进行全信息记录。
　　(二)电子数据交换系统(EDI)
　　电子数据交换系统(Electronic Data Interchange，简称EDI)是商品流通企业在经营活动中与其贸易伙伴或社会配套服务者，通过网络等通信手段，将数据、报表等按照协议在计算机之间自动进行固定格式的数据交换。其优势在于数据交换快速、准确;交换的数据格式统一;减少人为错误;节省大量报表用纸，降低成本。
　　(三)电子订货系统(EOS)
　　电子订货系统( Electronic ordering system, 缩写 EOS )，是指通过对企业库存、顾客需求调查、市场分析、企业内的销售统计等多种因素进行分析后，制定订货策略和具体订货计划，并通过网络通信等技术手段直接向制造商、供应商进行电子订货。优势在于：一是扩大采购资源;二是降低采购成本;三是与相关的贸易伙伴保持良好的信息沟通;四是控制合理库存;五是把握最佳进货时机。
　　(四)网络加值系统(VAN)
　　网络加值系统，Value Network，VAN，简单理解就是将批发商、零售商、制造商相关的商业信息，通过计算机网络互相交换、共享的信息管理系统。它的优势在于把相关参与者(除了批发商、零售商、制造商，还有销售对象、金融机构、物流商等)的信息加以收集、存储、加工，使之成为统一的信息资源，利用网络系统，供参与者进行信息交流。
　　(五)决策支持系统(DSS)
　　DSS，Decision Support System，顾名思义，就是为企业决策提供支撑的计算机系统。以管理科学、计算机科学、经济数学、行为科学和控制论为基础，以计算机技术、人工智能技术和信息技术为手段，为决策者提供决策所需要的数据、方法、信息和背景资料，帮助决策者明确目标，建立和修改模型，提供备选方案。但是，要注意最终决策还是要决策者制定，决策支持系统只是起到辅助作用。商品流通企业的决策支持系统是指在商品流通企业管理信息系统的基础上，配合以历史资料数据库(也称数据库)、经济数学模型(也成模型库)、专家知识库(也称方法库)等系统储备，由企业管理决策者综合各种信息资源，在决策支持系统的帮助下，制定企业决策的系统。
　　(六)其他子系统
　　商品流通企业的管理信息系统还包括财务管理系统、成本核算系统、行政管理系统、合同管理系统、公共信息发布系统等子系统。